香港中文大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程碩士課程由生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)系開設(shè)。課程邀請了來自醫(yī)學(xué)院，生命科學(xué)學(xué)院和工程學(xué)院的教授授課，內(nèi)容涵蓋了生物科學(xué)、醫(yī)學(xué)及工程等一系列的重要課題，其中包括生物化學(xué)技術(shù)、生物信息學(xué)、生物力學(xué)、生物納米技術(shù)、醫(yī)學(xué)成像、康復(fù)、假肢、醫(yī)療器械和醫(yī)療器械監(jiān)管等。學(xué)生可在課堂上接觸到不同范疇的專業(yè)人士，從而獲取最新資訊及技術(shù)內(nèi)容。

香港中文大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程碩士課程旨在在醫(yī)療儀器、生物感測器、生物資訊、生物材料、醫(yī)學(xué)生物科技的廣闊領(lǐng)域中，培育一群受良好培訓(xùn)的生物醫(yī)學(xué)工程師做先驅(qū)，以及在生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)里栽培未來的領(lǐng)袖。

香港中文大學(xué)運動醫(yī)學(xué)及健康科學(xué)碩士課程首創(chuàng)于2004年，是香港地區(qū)第一個也是唯一一個的授課式運動醫(yī)學(xué)課程。香港中文大學(xué)運動醫(yī)學(xué)及健康科學(xué)碩士課程為醫(yī)生、理療師、護士、運動科學(xué)家及所有健康與健身相關(guān)領(lǐng)域的人士提供提供嚴格的專業(yè)性培訓(xùn)，力爭將其培養(yǎng)成未來臨床研究或?qū)I(yè)實踐領(lǐng)域中的精英。運動醫(yī)學(xué)課程被公認為該領(lǐng)域的領(lǐng)航者。香港中文大學(xué)運動醫(yī)學(xué)及健康科學(xué)碩士旨在為學(xué)生提供運動醫(yī)學(xué)及健康科學(xué)方面的最前沿的知識和最新研究成果，為以后事業(yè)發(fā)展做好準備；使學(xué)生掌握關(guān)于運動醫(yī)學(xué)及健康科學(xué)的深入知識，同時注重提升自身專業(yè)技能，提高專業(yè)能力。運動醫(yī)學(xué)課程向?qū)W生介紹運動損傷管理領(lǐng)域最先進的診斷評估工具和治療方式。例如，學(xué)生將對運動軟組織受傷的原因、治療及康復(fù)有更深刻更全面的認識。香港中文大學(xué)運動醫(yī)學(xué)及健康科學(xué)碩士課程培養(yǎng)學(xué)生對危害健康行為和運動風(fēng)險因素評估的能力，從而能夠激勵運動員/運動愛好者等改變不良健康習(xí)慣，養(yǎng)成健康的生活方式；為不同健康學(xué)科的專業(yè)人士提供一個在經(jīng)驗分享的平臺，促進跨學(xué)科合作；并給學(xué)生提供向海外專家學(xué)習(xí)并交流知識的機會。

香港中文大學(xué)中醫(yī)學(xué)碩士課程由香港中文大學(xué)中醫(yī)學(xué)院開辦，為有志于修讀中醫(yī)學(xué)理論及臨床課程的非中醫(yī)專業(yè)的大學(xué)畢業(yè)生提供專業(yè)訓(xùn)練。香港中文大學(xué)中醫(yī)學(xué)碩士課程為全港唯一被香港中醫(yī)藥管理委員會認可的，其畢業(yè)生可申請參加香港中醫(yī)藥管理委員會中醫(yī)執(zhí)業(yè)資格試的中醫(yī)全日制碩士課程。香港中文大學(xué)中醫(yī)學(xué)碩士課程學(xué)生于首三年修讀中醫(yī)理論及中醫(yī)分科等科目，并包括現(xiàn)代醫(yī)學(xué)之基礎(chǔ)課程。最后一年赴廣州中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院或其他內(nèi)地中醫(yī)醫(yī)院、以及本港中醫(yī)診所接受中醫(yī)臨床實習(xí)訓(xùn)練。

香港中文大學(xué)骨關(guān)節(jié)醫(yī)學(xué)、康復(fù)及老年骨科理學(xué)碩士學(xué)位課程是結(jié)合了學(xué)校現(xiàn)有相關(guān)課程的綜合型項目。香港中文大學(xué)骨關(guān)節(jié)醫(yī)學(xué)、康復(fù)及老年骨科理學(xué)碩士學(xué)位課程旨在滿足對康復(fù)、肌骨骼醫(yī)學(xué)及老年骨科領(lǐng)域的醫(yī)療保健專業(yè)人員進行培訓(xùn)和教育的需求，以適應(yīng)老齡化人口增多與有關(guān)醫(yī)院管理局主要發(fā)展策略及香港特區(qū)政府醫(yī)療保健擴張計劃。