加州大學圣地亞哥分校斯克里普斯海洋所開設有以下五種學位項目：

高級研究碩士：學制1年，僅開設有海洋生物多樣性與保護這一個專業(yè)，主要是為海洋生物學相關領域的學生進修而開設的，該專業(yè)完全自費，無獎學金。

海洋學碩士：學制2年，共計36個學分，以研究為導向，需要撰寫畢業(yè)論文。該項目開設有三個專業(yè)方向——海洋學、海洋生物學和地球科學。該項目招收的人數(shù)有限，12月12日截止，其申請要求與研究生辦公室的規(guī)定一致。該項目的學生主要能申請一些TA獎學金，但數(shù)量同樣非常有限，因為TA獎學金也主要面向PhD學生開放

海洋學博士：該項目8月份開放申請，同年12月12日截止。主要分地球科學、海洋生物學、海洋學三個專業(yè)領域，外加3個學術項目，包括Climate-Ocean-Atmosphere Program、Geosciences of the Earth, Oceans、 Planets and the Ocean Biosciences Program。申請者需選定自己的專業(yè)領域后，再選定自己的學術項目，學術項目可以三選其二，但專業(yè)領域只可選一個。該項目所有學生一般都可以獲得為期五年的全額獎學金，而且第一年通常不會向學生發(fā)放對英語口語要求較高的TA獎學金。斯克里普斯海洋所PhD項目2015秋季學期招收的學生的平均GPA為3.6，一般錄取的學生的GRE成績均在80%以上；一般每年收到的申請數(shù)在350-400之間，但只錄取60-80名學生

雙學位項目：MBA/PhD雙學位項目，需先攻讀海洋所的PhD項目，然后向雷迪商學院申請同時攻讀MBA

聯(lián)合博士項目：與圣地亞哥州立大學聯(lián)合開設，需通過SDSU申請

加州大學圣地亞哥分校斯克里普斯海洋所各項目的申請方法、條件、學費等都與研究生辦公室的規(guī)定一致，TOEFL、IELTS要求等均相同，具體如下：

正規(guī)大學本科畢業(yè)，并取得學士以上學位
GPA：不低于3.0，尤其是大三大四的GPA不應低于3.0
TOEFL：不低于80分，IELTS不低于7.0分，均無單項要求
必需遞交GRE成績，PhD項目的海洋生物學專業(yè)還需要遞交相關的GRE Subject考試成績