普渡大學(xué)理學(xué)院開設(shè)的計算機(jī)科學(xué)系開設(shè)的研究生學(xué)位項目有：
計算機(jī)科學(xué)博士
計算機(jī)科學(xué)碩士-信息安全方向：屬專業(yè)碩士項目，主要是為本科非計算機(jī)科學(xué)背景的申請者提供的。該項目開設(shè)的研究方向有：信息安全基礎(chǔ)、密碼學(xué)、網(wǎng)絡(luò)安全、軟件安全、社會學(xué)、經(jīng)濟(jì)學(xué)與法律問題、安全性分析和數(shù)據(jù)安全與隱私。該項目申請截止日期為3月31日
計算機(jī)科學(xué)碩士：分帶畢業(yè)論文和不帶畢業(yè)論文兩種
計算機(jī)科學(xué)碩士：屬遠(yuǎn)程在線授課項目。全年分秋季學(xué)期和春季學(xué)期申請，秋季學(xué)期申請截止日期為7月1日，春季學(xué)期申請截止日期為11月1日。要求申請者本科畢業(yè)，擁有計算機(jī)科學(xué)或工程學(xué)專業(yè)背景。該項目以授課為主，無需撰寫畢業(yè)論文

跨學(xué)科項目：
計算機(jī)科學(xué)與工程項目
統(tǒng)計學(xué)與計算機(jī)科學(xué)聯(lián)合碩士項目
計算生命科學(xué)項目

此外，該系還向本土及國際學(xué)生提供實習(xí)項目。普渡大學(xué)計算機(jī)科學(xué)系2015學(xué)年秋季申請人數(shù)約1,192，錄取人數(shù)約76；2014學(xué)年秋季申請人數(shù)約1,112，錄取人數(shù)約82。該系要求申請者本科畢業(yè)，擁有計算機(jī)科學(xué)專業(yè)背景，博士項目申請還需具備相關(guān)研究或?qū)嶒炇医?jīng)，歷熟練數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、計算機(jī)架構(gòu)、操作系統(tǒng)、算法分析、編程語言等基礎(chǔ)，學(xué)習(xí)過微分方程、線性代數(shù)、數(shù)值理論、Java、C++等課程。2月份全月均可申請，結(jié)果一般在3月份公布。申請時，需遞交個人簡歷、導(dǎo)師推薦信及個人研究方向和感興趣的項目。所有學(xué)生一旦被錄取均有機(jī)會獲得系里提供的TA/RA或Fellowship獎學(xué)金。