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加州大學伯克利分校生物物理專業(yè)研究生階段僅開設有以下1個學位項目，即：生物物理博士：為期4-7年（視論文完成情況），要求申請者本科畢業(yè)，擁有與生物物理相關專業(yè)背景，如生物科學、結構生物學、物理、數(shù)學和化學，本科GPA3.0以上，需要遞交GRE成績，但未設定有最低分數(shù)要求，無需GRE物理科目成績，建議擁有實驗室科研經驗。該項目每年招收5-9名學生。國際學生可申請TA、RA等獎學金。
加州大學伯克利分校物理系研究生只招收PhD學生，且為研究生提供Fellowship、TA/RA獎學金，未獲得全額獎學金的學生將獲得導師給予的助研或助教機會。
| 排名 | 學校 | 專業(yè)（major） |
|---|---|---|
| 1 | 麻省理工學院 | 物理 |
| 1 | 斯坦福大學 | 物理 |
| 3 | 加州理工學院 | 物理 |
| 3 | 哈佛大學 | 物理 |
| 3 | 普林斯頓大學 | 物理 |
| 3 | 加州大學伯克利分校 | 物理 |
| 7 | 康奈爾大學 | 物理 |
| 7 | 芝加哥大學 | 物理 |
| 9 | 伊利諾伊大學香檳分校 | 物理 |
| 10 | 哥倫比亞大學 | 物理 |
| 10 | 加州大學圣塔芭芭拉分校 | 物理 |
| 12 | 耶魯大學 | 物理 |
| 13 | 密歇根大學安娜堡分校 | 物理 |
| 14 | 科羅拉多大學波德分校 | 物理 |
| 14 | 馬里蘭大學帕克分校 | 物理 |
| 14 | 賓夕法尼亞大學 | 物理 |
| 17 | 約翰霍普金斯大學 | 物理 |
| 17 | 加州大學洛杉磯分校 | 物理 |
| 17 | 加州大學圣地亞哥分校 | 物理 |
| 17 | 德克薩斯大學奧斯汀分校 | 物理 |
| 17 | 威斯康星大學麥迪遜分校 | 物理 |
| 22 | 華盛頓大學 | 物理 |
| 23 | 俄亥俄州立大學 | 物理 |
| 23 | 紐約州立大學石溪分校 | 物理 |
| 25 | 西北大學 | 物理 |
| 25 | 匹茲堡州立大學 | 物理 |
| 25 | 明尼蘇達大學雙城分校 | 物理 |
| 28 | 杜克大學 | 物理 |
| 28 | 佐治亞理工學院 | 物理 |
| 28 | 密歇根州立大學 | 物理 |
| 28 | 萊斯大學 | 物理 |
| 28 | 羅格斯大學 | 物理 |
| 28 | 加州大學戴維斯分校 | 物理 |
| 28 | 加州大學歐文分校 | 物理 |
| 35 | 布朗大學 | 物理 |
| 35 | 卡內基梅隆大學 | 物理 |
| 37 | 波士頓大學 | 物理 |
| 37 | 印第安納大學伯明頓分校 | 物理 |
| 37 | 紐約大學 | 物理 |
| 37 | 普渡大學西拉法葉分校 | 物理 |
| 37 | 亞利桑那大學 | 物理 |
| 37 | 加州大學圣克魯茲分校 | 物理 |
| 37 | 佛羅里達大學 | 物理 |
| 44 | 亞利桑那州立大學 | 物理 |
| 44 | 羅切斯特大學 | 物理 |
| 44 | 弗吉尼亞大學 | 物理 |
| 47 | 佛羅里達州立大學 | 物理 |
| 47 | 德州農工大學 | 物理 |
| 47 | 北卡羅來納大學教堂山分校 | 物理 |
| 47 | 匹茲堡大學 | 物理 |
| 47 | 圣路易斯華盛頓大學 | 物理 |
